Análisis de expresión diferencial de genes de la planta del tomate infectada con TYLCV

Abstract

El objetivo de este proyecto de fin de grado es la aplicación de diversas técnicas para el análisis exhaustivo de expresión diferencial de genes. Estas técnicas se aplicarán a la observación del comportamiento de la especie Solanum Lycopersicum (planta del tomate) ante una infección por el virus del rizado amarillo del tomate (TYLCV), el cual causa enanismo en las plantas, aspecto enredado de la misma y pérdida de vigor así como falta de fructificación. Para observar el efecto del virus en el comportamiento de la planta, se secuenció y analizó previamente el transcriptoma de la planta del tomate bajo distintas condiciones de infección mediante técnicas de RNA-Seq. Los resultados obtenidos mostraron aparentes inconsistencias en algunas de las comparaciones de la expresión de los genes de la planta y surgió así la necesidad de un análisis temporal de expresión diferencial. En este proyecto se pretende reunir y poner a prueba los conocimientos adquiridos a lo largo de la formación en este área de la bioinformática. Para ello se repetirá el análisis de expresión diferencial como verificación de los resultados previamente obtenidos y como comienzo de un estudio más complejo para observar la sobre o subexpresión de estos genes a lo largo del tiempo, las funciones de los genes más significativos y las características en común de los últimos.