El análisis RNA-seq dual como herramienta para el estudio de la interacción melón-Podosphaera xanthii

Abstract

El cultivo de las cucurbitáceas en España se ve afectado, entre otros, por el hongo biotrofo obligado Podosphaera xanthii, principal agente causal del oídio de las cucurbitáceas. Este patógeno representa uno de los factores limitantes más importantes de estos cultivos, incrementando los costes de producción y limitando el rendimiento. Actualmente, la aplicación de fungicidas continúa siendo la principal herramienta de lucha contra esta enfermedad. Sin embargo, el control químico es más ineficaz de lo esperado debido a la facilidad con la que P. xanthii desarrolla resistencias. Profundizar en la biología básica del oídio de las cucurbitáceas se hace indispensable para el desarrollo de medidas de control más racionales y duraderas. Para ello, en este trabajo se ha realizado un análisis RNA-seq dual de la interacción P. xanthii – melón con el fin de comprender, de manera global, las interacciones moleculares que ocurren entre el patógeno y el huésped,a través de la cuantificación de los cambios de expresión génica en los primeros estadios de desarrollo de la enfermedad (0, 24, 48 y 72 hpi). Con los datos obtenidos se ha realizado un análisis time course y un posterior enriquecimiento funcional, que nos ha permitido diferenciar la dinámica de expresión génica de P. xanthii, así como aquellos genes que siguen un patrón característico de sobreexpresión y represión en melón como consecuencia de la infección. Todo ello nos aporta una información muy útil para comprender mejor como se desarrolla la interacción P.xanthii –melón y nos acerca un poco más al desarrollo de nuevos métodos de control eficaces.