Evaluación de proteínas séricas e isoformas de procesamiento alternativo del ARN como biomarcadores no invasivos en Esclerosis Múltiple: descubrimiento y validación

Abstract

La esclerosis múltiple (EM) es una enfermedad autoinmune crónica del sistema nervioso central caracterizada por inflamación, desmielinización y neurodegeneración desde fases tempranas, lo que da lugar a una elevada heterogeneidad clínica. Aunque los criterios diagnósticos han evolucionado gracias a la incorporación de herramientas como la resonancia magnética y los biomarcadores en líquido cefalorraquídeo, persiste la necesidad de marcadores sensibles y específicos que permitan mejorar el diagnóstico, predecir la progresión y monitorizar la actividad de la enfermedad, especialmente en sangre, por su carácter accesible y mínimamente invasivo. Esta tesis tiene como objetivo identificar y validar biomarcadores proteómicos y transcriptómicos en sangre periférica con valor diagnóstico y pronóstico en EM, así como su capacidad para discriminar entre las distintas formas clínicas (EM remitente-recurrente, secundaria progresiva y primaria progresiva), controles sanos y otras enfermedades neurológicas inflamatorias. Para ello, se emplearon aproximaciones ómicas de alto rendimiento, combinando proteómica sérica mediante UHPLC-HRMS y transcriptómica basada en RNA-seq de isoformas generadas por procesamiento alternativo. El análisis proteómico identificó proteínas diferencialmente expresadas implicadas en procesos clave como inflamación, estrés oxidativo, regulación inmune y activación del complemento, algunas de las cuales mostraron asociaciones significativas con la discapacidad y la gravedad de la enfermedad, destacando su potencial como biomarcadores clínicos. La validación mediante ELISA confirmó la capacidad discriminativa de varias de estas proteínas. Por otro lado, el análisis transcriptómico reveló perfiles específicos de isoformas de procesamiento alternativo asociados a cada forma clínica de EM, reflejando diferencias en mecanismos inflamatorios, neurodegenerativos y de daño celular. La validación por qPCR y los análisis ROC demostraron una elevada capacidad diagnóstica y de clasificación clínica, especialmente al combinar múltiples marcadores. En conjunto, estos resultados respaldan el valor de integrar proteómica y transcriptómica para capturar la complejidad molecular de la EM y avanzar hacia una medicina más personalizada basada en biomarcadores accesibles y no invasivos.