Análisis de la actividad antimicrobiana de un clon con ADN metagenómico proveniente de una pila de compostaje de una refinería

Abstract

La expansión de los mecanismos de resistencia a los antimicrobianos actuales entre las bacterias patógenas está dando lugar a bacterias multirresistentes que suponen un grave problema de salud pública y se estima que, de no tomarse las medidas adecuadas, el número de muertes debidas a microorganismos resistentes en 2050 podría superar las debidas al cáncer. Para combatir estas bacterias multirresistentes es necesario encontrar nuevos antimicrobianos (AM). Los antibióticos actuales derivan de AM naturales, muchos producidos por bacterias. Sin embargo, la extraordinaria diversidad microbiana aún permanece oculta en la naturaleza por la imposibilidad de cultivar la mayoría de los microorganismos naturales en el laboratorio. Una alternativa para evitar estas limitaciones es la metagenómica, donde se accede directamente al ADN ambiental sin necesidad de cultivar el microorganismo de origen. La metagenómica funcional permite la expresión heteróloga de ADN ambiental en una bacteria huésped y la detección de un fenotipo asociada a la adquisición del clon de ADN metagenómico que codifique una actividad particular. Disponemos de varias metagenotecas y estirpes especializadas que aumentan las posibilidades de expresar el ADN metagenómico (1, 2). Actualmente estamos escrutando estas metagenotecas en busca de nuevas actividades antimicrobianas. El clon UPO15 es uno de los clones con este tipo de actividad, aislado a partir de una metagenoteca de una pila de compostaje de una refinería. El clon presenta actividad antimicrobiana frente a Staphylococcus aureus MRSA, uno de los patógenos multirresistentes que más preocupan a las instituciones sanitarias europeas. El análisis de la secuencia de UPO15 indica que no contiene ningún gen relacionado anteriormente con la producción de antimicrobianos. En este trabajo presentamos la caracterización inicial de la actividad antimicrobiana de UPO15, así como la identificación de los genes responsables de dicha actividad.