RT Dissertation/Thesis
T1 Optimización de la Entrada Salida mediante librerías y lenguajes paralelos
A1 Larrosa-Jiménez, Rafael
K1 Superordenadores
AB Uno de los grandes retos de la HPC (High Performance Computing) consiste enoptimizar el subsistema de Entrada/Salida, (E/S), o I/O (Input/Output). KenBatcher resume este hecho en la siguiente frase: "Un supercomputador es undispositivo que convierte los problemas limitados por la potencia de cálculo enproblemas limitados por la E/S" ("A Supercomputer is a device for turning compute-boundproblems into I/O-bound problems") . En otras palabras, el cuello de botella ya noreside tanto en el procesamiento de los datos como en la disponibilidad de losmismos. Además, este problema se exacerbará con la llegada del Exascale y lapopularización de las aplicaciones Big Data.En este contexto, esta tesis contribuye a mejorar el rendimiento y la facilidadde uso del subsistema de E/S de los sistemas de supercomputación.Principalmente se proponen dos contribuciones al respecto: i) una interfaz deE/S desarrollada para el lenguaje Chapel que mejora la productividad delprogramador a la hora de codificar las operaciones de E/S; y ii) unaimplementación optimizada del almacenamiento de datos de secuencias genéticas.Con más detalle, la primera contribución estudia y analiza distintasoptimizaciones de la E/S en Chapel, al tiempo que provee a los usuarios de unainterfaz simple para el acceso paralelo y distribuido a los datos contenidos enficheros. Por tanto, contribuimos tanto a aumentar la productividad de losdesarrolladores, como a que la implementación sea lo más óptima posible.La segunda contribución también se enmarca dentro de los problemas de E/S, peroen este caso se centra en mejorar el almacenamiento de los datos de secuenciasgenéticas, incluyendo su compresión, y en permitir un uso eficiente de esosdatos por parte de las aplicaciones existentes, permitiendo una recuperacióneficiente tanto de forma secuencial como aleatoria. Adicionalmente, proponemosuna implementación paralela basada en Chapel.
PB Servicio de Publicaciones y Divulgación Científica
YR 2016
FD 2016
LK http://hdl.handle.net/10630/11730
UL http://hdl.handle.net/10630/11730
LA spa
DS RIUMA. Repositorio Institucional de la Universidad de Málaga
RD 19 ene 2026