RT Journal Article
T1 Single-Cell RNA Sequencing Maps Endothelial Metabolic Plasticity in Pathological Angiogenesis.
A1 Rohlenova, Katerina
A1 Goveia, Jermaine
A1 García-Caballero, Melissa
A1 Subramanian, Abhishek
A1 Kalucka, Joanna
A1 Treps, Lucas
A1 D Falkenberg, Kim
A1 P M H de Rooij, Laura
A1 Zheng, Yingfeng
A1 Lin, Lin
A1 Sokol, Liliana
A1 Teuwen, Laure-Anne
A1 Vincent, Geldhof
A1 Taverna, Federico
A1 Pircher, Andreas
A1 Conradi, Lena-Christin
A1 Khan, Shawez
A1 Stegen, Steve
A1 Panovska, Dena
A1 De Smet, Frederik
A1 J T Staal, Frank
A1 J Mclaughlin, Rene
A1 Vinckier, Stefan
A1 Van Bergen, Tine
A1 Ectors, Nadine
A1 De Haes, Patrik
A1 Wang, Jian
A1 Bolund, Lars
A1 Schoonjans, Luc
A1 Karakach, Tobias K.
A1 Yang, Huanming
A1 Carmeliet, Geert
A1 Liu, Yizhi
A1 Thienpont, Bernard
A1 Dewerchin, Mieke
A1 Eelen, Guy
A1 Li, Xuri
A1 Luo, Yonglun
A1 Carmeliet, Peter
K1 Neovascularización
K1 Antiangiogénicos
AB El metabolismo de las células endoteliales (CE) es un objetivo emergente para la terapia antiangiogénica en la angiogénesis tumoral y la neovascularización coroidea (CNV), pero se sabe poco sobre los transcriptomas metabólicos individuales de las CE. Mediante la secuenciación de ARN de una sola célula de 28.337 CE coroideas murinas (CEC) y la germinación de CE-CNV, construimos una taxonomía para caracterizar su heterogeneidad. La comparación con las CE de tumores pulmonares murinos (TEC) reveló una expresión de genes marcadores congruentes por distintos fenotipos de CE en distintos tejidos y enfermedades, lo que sugiere mecanismos angiogénicos similares. La inferencia de trayectoria predijo que la diferenciación de CE venosas a angiogénicas estuvo acompañada de plasticidad del transcriptoma metabólico. Las CE mostraron heterogeneidad del transcriptoma metabólico durante la progresión del ciclo celular y en la inactividad. Partiendo de la hipótesis de que los genes conservados son importantes, utilizamos un análisis integrado, basado en el análisis del transcriptoma congruente, un modelo metabólico a escala del genoma adaptado a CEC y un metanálisis de expresión genética en conjuntos de datos entre especies, seguido de una validación in vitro e in vivo, para identificar a SQLE y ALDH18A1 como objetivos angiogénicos metabólicos previamente desconocidos.
PB Cell Press
YR 2020
FD 2020-04-07
LK https://hdl.handle.net/10630/35520
UL https://hdl.handle.net/10630/35520
LA eng
NO 2020 Apr 7;31(4):862-877.e14
NO https://openpolicyfinder.jisc.ac.uk/id/publication/6582
DS RIUMA. Repositorio Institucional de la Universidad de Málaga
RD 20 ene 2026