RT Dissertation/Thesis
T1 Desarrollo de herramientas genómicas en frutales subtropicales: aguacate y chirimoyo
A1 Talavera Judez, Alicia
K1 Plantas tropicales - Tesis doctorales
K1 Genómica - Tesis doctorales
AB El aguacate (Persea americana Mill.) y el chirimoyo (Annona cherimola Mill.) son doscultivos nativos de los Neotrópicos muy apreciados desde tiempos precolombinos. Ademásde su interés agrícola, tienen el valor añadido de pertenecer a uno de los grupos másprimitivos de las angiospermas, por lo que son de gran importancia para estudios evolutivosen plantas. No obstante, la información molecular generada en estas especies es escasa, loque dificulta su estudio y la disponibilidad de herramientas para optimizar el proceso demejora. Con el objetivo de reducir esta brecha e incrementar los recursos genómicosdisponibles en estas especies se ha llevado a cabo este estudio, que se divide en tresobjetivos: (1) desarrollar marcadores moleculares SNPs mediante GBS para lacaracterización de genotipos de aguacate (Persea americana Mill.), (2) ensamblar y anotar elprimer genoma del chirimoyo (Annona cherimola Mill.) y (3) elaborar un mapa de ligamientoen el género Annona a partir de una población F2 generada a partir de un cruzamientointerespecífico (Annona cherimola ‘Fino de Jete’ x Annona squamosa ‘Thai seedless’).El desarrollo de un borrador de genoma de aguacate (cv. Hass) junto a la secuenciación degenotecas mediante GBS han permitido detectar un total de 7.108 SNPs, los cuales hanfacilitado la caracterización de 71 genotipos que representan las 3 razas botánicas (Mexicana,Guatemalteca y Antillana) de esta especie. Además, estos marcadores moleculares hanfacilitado la caracterización de la diversidad genética y la estructura poblacional, mostrandoclaras agrupaciones basadas en el origen racial.
PB UMA Editorial
YR 2021
FD 2021-02-03
LK https://hdl.handle.net/10630/20930
UL https://hdl.handle.net/10630/20930
LA spa
NO Por otro lado, se ha generado el primer ensamblaje y anotación de novo del genoma delchirimoyo (cv. Fino de Jete), siendo el primer genoma dentro de la familia Annonaceae. Estegenoma está formado por un total de 15.076 secuencias y un N50 de 171,2 Kb.Aproximadamente, el 67 % de las secuencias son repetitivas, y los genes predichos seencuentran asociados a un evento de hibridación o duplicación reciente, que podría estargenerando cierta inestabilidad cromosomal.Finalmente, se ha desarrollado por primera vez un mapa genético para el género Annona apartir de una población F2, generada del autocruzamiento de individuos de una F1 realizada apartir de un cruce interespecífico entre ‘Fino de Jete’ (Annona cherimola) y ‘Thai seedless’(Annona squamosa). Se empleó un total de 550 SNPs para la construcción del mapa genético,que se distribuyeron en 8 grupos de ligamiento. El mapa generado cubre aproximadamente1.388 cM con una distancia media entre marcadores de 2,6 cM, tratándose del primer mapagenerado para estas especies (A. cherimola y A. squamosa).Los resultados obtenidos en este trabajo aportan nuevos conocimientos sobre aguacate ychirimoyo que son esenciales para la optimización de programas de mejora, pero tambiénabren las puertas a futuros trabajos de estudio de la diversidad genética, conservación oevolución de las angiospermas.
DS RIUMA. Repositorio Institucional de la Universidad de Málaga
RD 22 ene 2026