Listar por autor "Seoane Zonjic, Pedro"
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Analysis of hypervariable DNA sequences by NGS technologies: QuasiFlow
Viguera-Mínguez, Enrique
; Díaz-Martínez, Luis; Grande-Pérez, Ana; Claros-Díaz, Manuel Gonzalo; Seoane Zonjic, Pedro (2016-11-14)
The development of Next Generation Sequencing (NGS) technologies has allowed deep characterization of highly variable sequences such as viral or mitochondrial genomes. With respect to RNA and ssDNA viruses, their low ... -
Analysis of viral quasispecies by NGS technologies: quasiflow
Díaz-Martínez, Luis; Seoane Zonjic, Pedro; Claros-Díaz, Manuel Gonzalo; Viguera-Mínguez, Enrique; Grande-Pérez, Ana (Sociedad Española de Virología, 2017)
We have developed QuasiFlow, a workflow designed in AutoFlow that takes advantage of NGS technologies to reconstruct quasispecies based in Illumina reads. QuasiFlow characterises and computes several key parameters, such ... -
Creación y uso de los flujos de trabajo bioinformáticos
(UMA Editorial, 2016)En el año 2012 comencé mi doctorado en el Departamento de Biología Molecular y Bioquímica, aunque alojado en la Plataforma Andaluza de Bioinformática (PAB), emplazado en el edificio de Supercomputación y Bioinnovación sito ... -
Identificación del probiótico Shewanella putrefaciens Pdp11 mediante PCR a través del transposón único que interrumpe al gen que codifica para la proteína fenazina.
Pérez-Gómez, Olivia; Roca-Fernández, Sara; Seoane Zonjic, Pedro; Tapia-Paniagua, Silvana Teresa; Balebona-Accino, María del Carmen; Moriñigo-Gutiérrez, Miguel Ángel[et al.] (2023)
Shewanella putrefaciens Pdp11 es una cepa descrita como probiótico en peces de importancia acuícola. La secuenciación de su genoma ha permitido establecer comparaciones a nivel genómico con otras cepas patógenas pertenecientes ... -
Integrating differential expression, co-expression and gene network analysis for the identification of common genes associated with tumor angiogenesis deregulation
Monterde, Beatriz; Rojano Rivera, María Elena; Córdoba Caballero, José; Seoane Zonjic, Pedro; Perkins, James Richard; Medina-Torres, Miguel Ángel; García-Ranea, Juan Antonio[et al.] (Elsevier, 2023)
Angiogenesis is essential for tumor growth and cancer metastasis. Identifying the molecular pathways involved in this process is the first step in the rational design of new therapeutic strategies to improve cancer treatment. ... -
Respuesta transcriptómica del intestino de Solea senegalensis tras la administración dietética del probiótico Shewanella putrefaciens Pdp11
Cerezo Ortega, Isabel M.; Domínguez-Maqueda, Marta; Córdoba Caballero, José; Seoane Zonjic, Pedro; Tapia-Paniagua, Silvana Teresa; Moriñigo-Gutiérrez, Miguel Ángel; Balebona-Accino, María del Carmen[et al.] (2022)
El uso de probióticos en acuicultura mejora la salud y el bienestar de los animales, en el caso del probiótico SpPdp11 se han observado numerosos beneficios a nivel de inmunidad, estrés y microbiota intestinal. Sin embargo, ... -
SpPdp11 Administration in Diet Modified the Transcriptomic Response and Its Microbiota Associated in Mechanically Induced Wound Sparus aurata Skin
Cerezo Ortega, Isabel M.; Pérez-Gómez, Olivia; Bautista-Moreno, Rocío; Seoane Zonjic, Pedro; Esteban, María Ángeles; Balebona-Accino, María del Carmen; Moriñigo-Gutiérrez, Miguel Ángel; Tapia-Paniagua, Silvana Teresa[et al.] (MDPI, 2023)
Skin lesions are a frequent fact associated with intensive conditions affecting farmed fish. Knowing that the use of probiotics can improve fish skin health, SpPdp11 dietary administration has demonstrated beneficial effects ...