• A New Multi-Objective Approach for Molecular Docking Based on RMSD and Binding Energy 

      López-Camacho, Esteban; García Godoy, María Jesús; García-Nieto, José; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesus; Aldana-Montes, Jose Francisco (2016-07-12)
      Ligand-protein docking is an optimization problem based on predicting the position of a ligand with the lowest binding energy in the active site of the receptor. Molecular docking problems are traditionally tackled with ...
    • A Study of Archiving Strategies in Multi-Objective PSO for Molecular Docking 

      García-Nieto, José; López-Camacho, Esteban; García Godoy, María Jesús; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesus; Durillo, Juan J.; [et al.] (2016-09-30)
      Molecular docking is a complex optimization problem aimed at predicting the position of a ligand molecule in the active site of a receptor with the lowest binding energy. This problem can be formulated as a bi-objective ...
    • Application of Semantics to Solve Problems in Life Sciences 

      García Godoy, María Jesús (UMA Editorial, 2018)
      La cantidad de información que se genera en la Web se ha incrementado en los últimos años. La mayor parte de esta información se encuentra accesible en texto, siendo el ser humano el principal usuario de la Web. Sin embargo, ...
    • Docking Inter/Intra-Molecular Mediante Metaheurísticas Multi-objetivo 

      López-Camacho, Esteban; García Godoy, María Jesús; García-Nieto, José; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesus; Aldana-Montes, Jose Francisco (2015-02-11)
      El Acoplamiento Molecular (Molecular Docking) es un problema de optimización de gran complejidad que consiste en predecir la orientación de dos moléculas: el ligando y el receptor, de manera que formen un complejo molecular ...
    • Enriquecimiento automático de ontologías biomédicas mediante el uso de mappings 

      García Godoy, María Jesús; López-Camacho, Esteban; Roldan-Garcia, Maria del Mar; Aldana-Montes, Jose Francisco (2018-11-15)
      Dione es una representación en OWL del ICD-10-CM, consistente lógicamente, cuyos axiomas definen las inclusiones y exclusiones del ICD-10-CM mediante una metodología basada en los mappings ICD-10-CM/SNOMED-CT, proporcionados ...
    • Estudio de Estrategias de Archivo en PSO Multi-Objetivo para el Docking Molecular 

      López-Camacho, Esteban; García Godoy, María Jesús; García-Nieto, José; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesus; Aldana-Montes, Jose Francisco (2016)
      El acoplamiento molecular es un problema de optimización complejo cuyo objetivo es la predicción de la posición de un ligando en el sitio activo de un receptor con la mínima energía de unión. Este problema puede ser formulado ...
    • iNGS: a prototype tool for genome interpretation and annotation 

      Navas-Delgado, Ismael; García Godoy, María Jesús; Arjona-Pulido, Fátima; Castillo-Castillo, Trinidad; Ramos-Ostio, Ana Isabel; [et al.] (EMBnet.journal, 2013)
      Currently, clinical interpretation of whole-genome NGS genetic findings are very low-throughput because of a lack of computational tools/software. The current bottleneck of whole-genome and whole-exome sequencing projects ...