Listar por autor "Ujaldon-Martínez, Manuel"
Mostrando ítems 1-18 de 18
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Aceleración en GPU del procesamiento de imágenes cerebrales de alta resolución
(2017-02-09)Durante los últimos años se ha venido demostrando el alto poder computacional que ofrecen las GPUs a la hora de resolver determinados problemas. Al mismo tiempo, existen campos en los que no es posible beneficiarse ... -
Aceleración en GPU del procesamiento de vóxeles en tiempo real
(2019-12-16)En la actualidad, existen muchos sistemas que necesitan tratar una gran cantidad de datos en un tiempo muy bajo. Los sistemas de procesamiento de datos en tiempo real son uno de los más relevantes. Este sistema necesita ... -
Acelerando los momentos de Zernike sobre Kepler
Ruiz, Antonio; Ujaldon-Martínez, Manuel
(2014-05-02)
Este trabajo analiza las características más avanzadas de la arquitectura Kepler de Nvidia, principalmente el paralelismo dinámico para el lanzamiento de kernels desde la GPU y la planificación de hilos con Hyper-Q. ... -
Clasificación Tisular en GPU: aceleración y optimizaciones
(Servicio de Publicaciones y Divulgación Científica, 2015)Desde hace una década, los procesadores gráficos o GPUs vienen ganando protagonismo en la computación de altas prestaciones, contribuyendo a la aceleración de miles de aplicaciones en multitud de áreas de la ciencia. Pero ... -
DNA Sequences Alignment in Multi-GPUs: Energy Payoff on Speculative Executions
Pérez-Serrano, Jesús; Sandes, Edans; Melo, Alba; Ujaldon-Martínez, Manuel (2017-05-30)
We present a performance per watt analysis of CUDAlign 4.0, a parallel strategy to obtain the optimal alignment of huge DNA se- quences in multi-GPU platforms using the exact Smith-Waterman method. Speed-up factors and ... -
Energy-based tuning of convolution neural networks on multi-GPUs
Castro Payán, Francisco Manuel; Guil-Mata, Nicolás; Marín Jiménez, Manuel Jesús; Pérez-Serrano, Jesús; Ujaldon-Martínez, Manuel (Wiley, 2019-11)
Deep Learning (DL) applications are gaining momentum in the realm of Artificial Intelligence, particularly after GPUs have demonstrated remarkable skills for accelerating their challenging computational requirements. Within ... -
Energy-based tuning of metaheuristics for molecular docking on multi-GPUs
Pérez-Serrano, Jesús; Imbernón, Baldomero; Cecilia, José María; Ujaldon-Martínez, Manuel (Wiley, 2018-09)
Virtual Screening (VS) methods simulate molecular interactions in silico to look for the best chemical compound that interacts with a given molecular target. VS is becoming increasingly popular to accelerate the drug ... -
Entropy-based High Performance Computation of Boolean SNP-SNP Interactions Using GPUs
Riveros, Carlos; Ujaldon-Martínez, Manuel; Moscato, Pablo (2014-05-02)
It is being increasingly accepted that traditional statistical Single Nucleotide Polymorphism (SNP) analysis of Genome-Wide Association Studies (GWAS) reveals just a small part of the heritability in complex diseases. ... -
GPGPU: Challenges ahead
Ujaldon-Martínez, Manuel (2015-11-13)
Evolución, presente y futuro de la memoria DRAM del computador desde el punto de vista de los procesadores gráficos actuales, y su contribución presente y futura para la aceleración de aplicaciones científicas. -
GPUs for high performance computing, Deep learning and beyond
Ujaldon-Martínez, Manuel (2019-10-24)
After an impressive evolution within the last decade, Graphics Processing Units (GPUs) constitute nowadays a solid trend to accelerate scientific applications. This talk unveils the GPU architecture from an ... -
GPUs para HPC: Logros y perspectivas futuras
Ujaldon-Martínez, Manuel (2013-10-18)
Hace una década comenzábamos a mejorar las primeras aplicaciones científicas en GPUs utilizando Cg y OpenGL. Ahora CUDA y OpenCL han tomado el relevo, marcando un ritmo vertiginoso en la aceleración de códigos procedentes ... -
HPC Accelerators with 3D Memory
Ujaldon-Martínez, Manuel (2016-09-13)
After a decade evolving in the High Performance Computing arena, GPU-equipped supercomputers have con- quered the top500 and green500 lists, providing us unprecedented levels of computational power and memory bandwidth. ... -
Procesamiento de imágenes cerebrales en GPU
(2016-05-19)As time has passed, the general purpose programming paradigm has evolved, producing different hardware architectures whose characteristics differ widely. In this work, we are going to demonstrate, through different applications ... -
Programming GPUs with CUDA
Ujaldon-Martínez, Manuel (2015-11-13)
Analizamos las prestaciones y características de las distintas generaciones de procesadores gráficos desarrollados por Nvidia para la programación de aplicaciones de propósito general bajo CUDA, un paradigma nuevo que ... -
Quantifying the regeneration of bone tissue in biomedical images via Legendre moments
We investigate the use of Legendre moments as biomarkers for an efficient and accurate classification of bone tissue on images coming from stem cell regeneration studies. Regions of either existing bone, cartilage or ... -
Smith-Waterman Acceleration in Multi-GPUs: A Performance per Watt Analysis
Pérez-Serrano, Jesús; Sandes, Edans; Melo, Alba; Ujaldon-Martínez, Manuel (Springer, 2017)
We present a performance per watt analysis of CUDAlign 4.0, a parallel strategy to obtain the optimal alignment of huge DNA se- quences in multi-GPU platforms using the exact Smith-Waterman method. Speed-up factors and ... -
Supercomputación gráfica aplicada al análisis de imágenes cerebrales con niftyreg
(2016-05-19)Abstract: Medical image processing in general and brain image processing in particular are computationally intensive tasks. Luckily, their use can be liberalized by means of techniques such as GPU programming. In this ... -
Weather Projections and Dynamical Downscaling for the Republic of Panama: Evaluation of Implementation Methods via GPGPU Acceleration
Pinzón, Reinhardt; Müller, Michel; Nakaegawa, Toshiyuki; Sánchez-Galán, Javier; Ujaldon-Martínez, Manuel; Fábrega, José[et al.] (2020-09)
Climate change could have a critical impact on the Republic of Panama where a major segment of the economy is dependent on the operation of the Panama Canal. New capabilities to do targeted research around climate change ...