Listar por autor "Veredas-Navarro, Francisco Javier"
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Advancing Deep Learning Solutions in the Era of Precision Medicine: From Omics Data to Clinical Narratives.
(UMA Editorial, 2024)The main objective of this PhD Thesis is the development of deep learning (DL)-based approaches to tackle inherently complex predictive problems in the domain of precision medicine. We have focused on two of the most ... -
Aprendizaje profundo aplicado a la bioinformática
(2018-12-17)Actualmente, el aprendizaje profundo (deep learning ) constituye una de las tecnologías del campo de la Inteligencia Artificial (IA) que goza de mayor éxito y popularidad. En campos como el procesamiento de imágenes y el ... -
Aprendizaje profundo aplicado a problemas de predicción de supervivencia en cáncer
(2020-01-13)El cáncer se cobró 18,1 millones de muertes a nivel mundial en 2018 y $87,8 billones para cuidados de salud durante el año 2014 en EEUU. El tremendo impacto que esta enfermedad supone a nivel mundial, junto con la ... -
Los átomos de azufre próximos a los anillos de residuos aromáticos son menos susceptibles de ser oxidados
El grupo tioéter de las metioninas confiere, a las proteínas portadoras, una alta vulnerabilidad a la oxidación. Sin embargo, no todos los residuos metionil de una proteína son igualmente susceptibles de oxidación. Aunque ... -
Clasificación de imágenes de úlceras por presión mediante el uso de técnicas de aprendizaje profundo.
(2019-11-25)Este Trabajo Fin de Grado ha consistido en un estudio del uso de redes convolucionales para la clasícación de imágenes de úlceras cutáneas producidas por presión. Las úlceras cutáneas producidas por presión pueden parecer ... -
Detection of tumor morphology mentions in clinical reports in Spanish using transformers
López-García, Guillermo; Jerez-Aragonés, José Manuel
; Ribelles, Nuria; Alba-Conejo, Emilio; Veredas-Navarro, Francisco Javier (Springer, 2021)
The aim of this study is to systematically examine the performance of transformer-based models for the detection of tumor morphology mentions in clinical documents in Spanish. For this purpose, we analyzed 3 transformer ... -
Enhancing cross-encoders using knowledge graph hierarchy for medical entity linking in zero- and few-shot scenarios
Gallego, Fernando; Ruas, Pedro; Couto, Francisco M.; Veredas-Navarro, Francisco Javier (Elsevier, 2025-03-01)
Medical Entity Linking (MEL) is a common task in natural language processing, focusing on the normalization of recognized entities from clinical texts using large knowledge bases (KBs). This task presents significant ... -
Explainable clinical coding with in-domain adapted transformers
López-García, Guillermo; Jerez-Aragonés, José Manuel; Ribelles, Nuria; Alba-Conejo, Emilio; Veredas-Navarro, Francisco Javier (Elsevier, 2023)
Background and Objective: Automatic clinical coding is a crucial task in the process of extracting relevant in-formation from unstructured medical documents contained in Electronic Health Records (EHR). However, most of ... -
Named Entity Recognition for De-identifying Real-World Health Records in Spanish.
López-García, Guillermo; Moreno-Barea, Francisco J.; Mesa, Héctor; Jerez-Aragonés, José Manuel; Ribelles, Nuria; Alba-Conejo, Emilio; Veredas-Navarro, Francisco Javier[et al.] (Springer Nature, 2023)
A growing and renewed interest has emerged in Electronic Health Records (EHRs) as a source of information for decision-making in clinical practice. In this context, the automatic de-identification of EHRs constitutes an ... -
Named entity recognition for de-identifying Spanish electronic health records
Moreno-Barea, Francisco J.; López-García, Guillermo; Mesa, Héctor; Ribelles, Nuria; Alba-Conejo, Emilio; Jerez-Aragonés, José Manuel; Veredas-Navarro, Francisco Javier[et al.] (Elsevier, 2025-02)
Background and objectives: There is an increasing and renewed interest in Electronic Health Records (EHRs) as a substantial information source for clinical decision making. Consequently, automatic de-identification of EHRs ... -
Prediction of Protein Oxidation Sites
Veredas-Navarro, Francisco Javier; Cantón, Francisco R.; Aledo-Ramos, Juan Carlos (Springer International Publishing AG, 2017-05-18)
Although reactive oxygen species are best known as damag- ing agents linked to aerobic metabolism, it is now clear that they can also function as messengers in cellular signalling processes. Methionine, one of the two ... -
Recognition and normalization of multilingual symptom entities using in-domain-adapted BERT models and classification layers
Gallego Donoso, Fernando; Veredas-Navarro, Francisco Javier (2024-08-28)
Due to the scarcity of available annotations in the biomedical domain, clinical natural language processing poses a substantial challenge, espe- cially when applied to low-resource languages. This paper presents our ... -
Segmentación de imágenes de úlceras por presión mediante aprendizaje profundo
(2022-06)Las úlceras por presión son lesiones producidas en la piel por una presión o fricción sufridas durante un gran periodo de tiempo. Estas úlceras presentan cinco tejidos, piel, periúlcera, granulación, esfacelos y necrótico, ... -
Software de apoyo a la decisión para el establecimiento de pautas correctoras de vacunación
(2016-06-27)En la actualidad, cualquier ámbito profesional cuenta con herramientas software especializadas que mejoran la productividad en la realización de tareas repetitivas o facilitan la ejecución de tareas críticas con un alto ... -
A transfer-learning approach to feature extraction from cancer transcriptomes with deep autoencoders
López-García, Guillermo; Jerez-Aragonés, José Manuel; Franco, Leonardo; Veredas-Navarro, Francisco Javier (2019-06-18)
The diagnosis and prognosis of cancer are among the more challenging tasks that oncology medicine deals with. With the main aim of fitting the more appropriate treatments, current personalized medicine focuses on using ...