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Listar por autor "Grande-Perez, Ana"
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Analysis of hypervariable DNA sequences by NGS technologies: QuasiFlow
Viguera-Minguez, Enrique; Díaz Martínez, Luis; Grande-Perez, Ana; Claros-Diaz, Manuel Gonzalo; Seoane Zonjic, Pedro (2016-11-14)The development of Next Generation Sequencing (NGS) technologies has allowed deep characterization of highly variable sequences such as viral or mitochondrial genomes. With respect to RNA and ssDNA viruses, their low ... -
Analysis of viral quasispecies by NGS technologies: quasiflow
Díaz-Martínez, Luis; Seoane Zonjic, Pedro; Claros-Diaz, Manuel Gonzalo; Viguera-Minguez, Enrique; Grande-Perez, Ana (Sociedad Española de Virología, 2017)We have developed QuasiFlow, a workflow designed in AutoFlow that takes advantage of NGS technologies to reconstruct quasispecies based in Illumina reads. QuasiFlow characterises and computes several key parameters, such ... -
Begomovirus quasispecies adapt to hosts by exploring different sequence space without changing their consensus sequences
Sánchez-Campos, Sonia; Domínguez-Huerta, Guillermo; Tomás, Diego; Navas-Castillo, Jesus; Moriones, Enrique; [et al.] (2014-10-14)Geminiviruses possess single-stranded circular DNA genomes that depend on cellular polymerases for replication in the host nucleus. In plant hosts, geminivirus populations behave as ensembles of mutant and recombinant ... -
Detección y caracterización de virus emergentes de ADN de plantas para una agricultura sostenible
Grande-Perez, Ana (2017-11-06)Los virus de la familia Geminiviridae son virus de ADN monocatenario circular mono- o bipartito encapsulados en partículas geminadas que afectan a cultivos de plantas mono y dicotiledóneas. Los geminivirus son patógenos ... -
Encuentros con la Ciencia II: del macrocosmos al microcosmos
Viguera-Minguez, Enrique; Grande-Perez, Ana; Lozano-Castro, José (Universidad de Málaga, Servicio de Publicaciones., 2010)“Encuentros con la Ciencia II: del macrocosmos al microcosmos” se trata del segundo volumen de un libro de divulgación científica que recoge los capítulos desarrollados por los ponentes que han impartido sus conferencias en ... -
Evolución de los begomovirus del rizado amarillo del tomate en presencia del alelo de tolerancia Ty-1
Dominguez Huerta, Guillermo (UMA Editorial, 2017-12-15)Esta tesis ha tenido como objetivo profundizar en el estudio de la evolución de los begomovirus asociados a la enfermedad del rizado amarillo del tomate en algunos de sus huéspedes. La enfermedad está causada por un complejo ... -
Experiencias de una red docente: aprendizaje significativo en ciencias y tecnología mediante gamificación
Grande-Perez, Ana; López-Ramírez, María Rosa; Bejar-Alvarado, Julia; Viguera-Minguez, Enrique; Thode Mayoral, Guillermo; [et al.] (2019-07-16)En el aprendizaje de los contenidos de materias científico-técnicas es especialmente importante la motivación del estudiante mediante referencias y ejercicios de casos reales donde se trata de reducir la memorización de ... -
Infectivity decline of an RNA plant virus by increased mutagenesis in vivo
Díaz Martínez, Luis; Brichette Mieg, Isabel; Grande-Perez, Ana (2014-08-01)According to the lethal defection model, during lethal mutagenesis viral genomes with a low degree of mutation and low specific infectivity exert an interfering activity that leads to virus loss. Lethal mutagenesis of plant ... -
Infectivity decline of an RNA plant virus by increased mutagenesis supports the lethal defection model in vivo
Brichette Mieg, Isabel; Díaz Martínez, Luis; Grande-Perez, Ana (2013-07-30)Lethal mutagenesis is a new antiviral therapy based on increasing the mutation rate by using mutagenic base and nucleoside analogues whose molecular mechanisms are not fully understood. Most of the research has been conducted ... -
Involvement of translesion polymerases in the generation of genetic variability or an emergent ssDNA plant virus
Díaz-Martínez, Luis; Viguera-Minguez, Enrique; Grande-Perez, Ana (2015-06-16)Single-stranded DNA (ssDNA) viruses such as animal circoviruses or plant geminiviruses are important emergent viruses. SsDNA viruses are as variable as their RNA equivalents and evolve quickly, with high mutation rates and ... -
Variabilidad genética de cuasiespecies de virus RNA y ssDNA in vivo ante cambios en la tasa de error
Díaz Martínez, Luis (UMA Editorial, 2016)El objetivo general de esta tesis es entender la estructura poblacional in vivo de las cuasiespecies de virus de RNA y ssDNA cuando se altera su variabilidad genética debido a cambios en la tasa de error. El abordaje de ... -
VII Encuentros con la Ciencia
Viguera-Minguez, Enrique; Grande-Perez, Ana; Lozano-Castro, José (UMA. SEDOC, 2009)La séptima edición de esta iniciativa aborda la teoría de la evolución y su implicación en el mundo actual a través de un recorrido por la vida y la obra de Charles Darwin.