• iNGS: a prototype tool for genome interpretation and annotation 

      Navas-Delgado, Ismael; García Godoy, María Jesús; Arjona-Pulido, Fátima; Castillo-Castillo, Trinidad; Ramos-Ostio, Ana Isabel; [et al.] (EMBnet.journal, 2013)
      Currently, clinical interpretation of whole-genome NGS genetic findings are very low-throughput because of a lack of computational tools/software. The current bottleneck of whole-genome and whole-exome sequencing projects ...
    • kpath: An example of metabolic pathway data integration using Linked Data 

      Navas-Delgado, Ismael; García-Godoy, Maria Jesús; López-Camacho, Esteban; Ribinski, Maciej; Reyes-Palomares, Armando; [et al.] (2016)
      The main databases related to metabolic pathways, such as Kegg, Brenda, Reactome and Biocyc, provide partially interlinked data on metabolic pathways. This limitation only allows independent searches to retrieve cross-database ...
    • La enseñanza del metabolismo: retos y oportunidades 

      Medina, Miguel Ángel; Suarez-Marin, Maria Fernanda; Alonso-Carrion, Francisco Jose; Valpuesta-Fernandez, Victoriano; Heredia-Bayona, Antonio; [et al.] (2017-12)
      Hemos estructurado los contenidos del libro en diversas secciones. La primera presenta el Proyecto en cuyo marco se ha gestado la iniciativa que ha conducido a la edición del presente libro. La segunda sección la hemos ...
    • Melanoma expression analysis with Big Data technologies 

      Fernandez-Rovira, Alicia; Lavado-Valenzuela, Rocio; Berciano-Guerrero, Miguel Angel; Navas-Delgado, Ismael; Aldana-Montes, Jose Francisco (PeerJ, 2017-09-26)
      Melanoma is a highly immunogenic tumor. Therefore, in recent years physicians have incorporated drugs that alter the immune system into their therapeutic arsenal against this disease, revolutionizing in the treatment of ...
    • Metaheurísticas de optimización multiobjetivo aplicadas a la inferencia filogenética y al alineamiento múltiple de secuencias 

      Zambrano Vega, Cristian Gabriel (UMA Editorial, 2017)
      La temática sobre la que ha girado esta tesis doctoral ha sido la optimización de dos problemas del campo de la Bioinformática: la Inferencia Filogenética y al Alineamiento Múltiple de Secuencias usando metaheurísticas ...
    • Multi-Objective Big Data Optimization with jMetal and Spark 

      Barba-González, Cristóbal; García-Nieto, José; Aldana-Montes, Jose Francisco; Nebro-Urbaneja, Antonio Jesus (2017-04-20)
      Big Data Optimization is the term used to refer to optimization problems which have to manage very large amounts of data. In this paper, we focus on the parallelization of metaheuristics with the Apache Spark cluster ...
    • Optimización multi-objetivo en las ciencias de la vida. 

      Lopez Camacho, Esteban (UMA Editorial, 2017-10-26)
      Las herramientas de acoplamiento molecular han llegado a ser bastante eficientes en el descubrimiento de fármacos y en el desarrollo de la investigación de la industria farmacéutica. Estas herramientas se utilizan para ...
    • Paralelización de algoritmos de minería de textos con Hadoop 

      Carrasco Barrios, Elena (2018-02-21)
      Este Trabajo Fin de Grado (TFG) tiene como objetivos paralelizar algoritmos de minería de textos para poder permitir su ejecución con una gran cantidad de textos en el menor tiempo posible y con usuarios concurrentes, y ...
    • Re-constructing Hidden Semantic Data Models by Querying SPARQL Endpoints 

      García-Godoy, Maria Jesús; López-Camacho, Esteban; Navas-Delgado, Ismael; Aldana-Montes, Jose Francisco (2016-10-24)
      Linked Open Data community is constantly producing new repositories that store information from different domains. The data included in these repositories follow the rules proposed by the W3C community, based on standards ...
    • Un repositorio RDF para la Integración de Flujos de Datos de Analítica Web y Comercio Electrónico 

      Roldan-Garcia, Maria del Mar; García-Nieto, José; Aldana-Montes, Jose Francisco (Ediciones Universidad Salamanca, 2016)
      La Analítica Web supone hoy en día una tarea ineludible para las empresas de comercio electrónico, ya que les permite analizar el comportamiento de sus clientes. El proyecto Europeo SME-Ecompass tiene como objetivo ...
    • Scalable Inference of Gene Regulatory Networks with the Spark Distributed Computing Platform Cristo 

      Barba-González, Cristóbal; García-Nieto, José; Benítez-Hidalgo, Antonio; Aldana-Montes, Jose Francisco (2018-11-05)
      Inference of Gene Regulatory Networks (GRNs) remains an important open challenge in computational biology. The goal of bio-model inference is to, based on time-series of gene expression data, obtain the sparse topological ...
    • Un Repositorio RDF para la integración y consulta de datos de pacientes hepáticos 

      Roldan-Garcia, Maria del Mar; Aldana-Montes, Jose Francisco (2018-10-03)
      Los casos médicos pasados, y por lo tanto, la experiencia clínica, son recursos de valor incalculable para apoyar la práctica clínica, la investigación y la formación. Los profesionales médicos deben poder intercambiar ...