JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

    Listar

    Todo RIUMAComunidades & ColeccionesPor fecha de publicaciónAutoresTítulosMateriasTipo de publicaciónCentrosEsta colecciónPor fecha de publicaciónAutoresTítulosMateriasTipo de publicaciónCentros

    Mi cuenta

    AccederRegistro

    Estadísticas

    Ver Estadísticas de uso

    DE INTERÉS

    Datos de investigaciónReglamento de ciencia abierta de la UMAPolítica de RIUMAPolitica de datos de investigación en RIUMASHERPA/RoMEODulcinea
    Preguntas frecuentesManual de usoDerechos de autorContacto/Sugerencias
    Ver ítem 
    •   RIUMA Principal
    • Investigación
    • Lenguajes y Ciencias de la Computación - (LCC)
    • LCC - Contribuciones a congresos científicos
    • Ver ítem
    •   RIUMA Principal
    • Investigación
    • Lenguajes y Ciencias de la Computación - (LCC)
    • LCC - Contribuciones a congresos científicos
    • Ver ítem

    A Study of Archiving Strategies in Multi-Objective PSO for Molecular Docking

    • Autor
      Garcia-Nieto, Jose ManuelAutoridad Universidad de Málaga; López-Camacho, Esteban; García Godoy, María Jesús; Nebro-Urbaneja, Antonio JesusAutoridad Universidad de Málaga; Durillo, Juan J.; Aldana-Montes, José FranciscoAutoridad Universidad de Málaga
    • Fecha
      2016-09-30
    • Palabras clave
      Optimización matemática
    • Resumen
      Molecular docking is a complex optimization problem aimed at predicting the position of a ligand molecule in the active site of a receptor with the lowest binding energy. This problem can be formulated as a bi-objective optimization problem by minimizing the binding energy and the Root Mean Square Deviation (RMSD) difference in the coordinates of ligands. In this context, the SMPSO multi-objective swarm-intelligence algorithm has shown a remarkable performance. SMPSO is characterized by having an external archive used to store the non-dominated solutions and also as the basis of the leader selection strategy. In this paper, we analyze several SMPSO variants based on different archiving strategies in the scope of a benchmark of molecular docking instances. Our study reveals that the SMPSOhv, which uses an hypervolume contribution based archive, shows the overall best performance.
    • URI
      http://hdl.handle.net/10630/12124
    • Compartir
      RefworksMendeley
    Mostrar el registro completo del ítem
    Ficheros
    ants2016.pdf (494.9Kb)
    Colecciones
    • LCC - Contribuciones a congresos científicos

    Estadísticas

    Ver Estadísticas de uso
    Buscar en Dimension
    REPOSITORIO INSTITUCIONAL UNIVERSIDAD DE MÁLAGA
    REPOSITORIO INSTITUCIONAL UNIVERSIDAD DE MÁLAGA
     

     

    REPOSITORIO INSTITUCIONAL UNIVERSIDAD DE MÁLAGA
    REPOSITORIO INSTITUCIONAL UNIVERSIDAD DE MÁLAGA