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Desarrollo de herramientas genómicas en frutales subtropicales: aguacate y chirimoyo
dc.contributor.advisor | Hormaza Urroz, José Ignacio | |
dc.contributor.advisor | Matas-Arroyo, Antonio Javier | |
dc.contributor.author | Talavera Judez, Alicia | |
dc.contributor.other | Biología Vegetal | es_ES |
dc.date.accessioned | 2021-02-03T13:21:14Z | |
dc.date.available | 2021-02-03T13:21:14Z | |
dc.date.issued | 2021-02-03 | |
dc.date.submitted | 2020-07-17 | |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/10630/20930 | |
dc.description | Por otro lado, se ha generado el primer ensamblaje y anotación de novo del genoma del chirimoyo (cv. Fino de Jete), siendo el primer genoma dentro de la familia Annonaceae. Este genoma está formado por un total de 15.076 secuencias y un N50 de 171,2 Kb. Aproximadamente, el 67 % de las secuencias son repetitivas, y los genes predichos se encuentran asociados a un evento de hibridación o duplicación reciente, que podría estar generando cierta inestabilidad cromosomal. Finalmente, se ha desarrollado por primera vez un mapa genético para el género Annona a partir de una población F2, generada del autocruzamiento de individuos de una F1 realizada a partir de un cruce interespecífico entre ‘Fino de Jete’ (Annona cherimola) y ‘Thai seedless’ (Annona squamosa). Se empleó un total de 550 SNPs para la construcción del mapa genético, que se distribuyeron en 8 grupos de ligamiento. El mapa generado cubre aproximadamente 1.388 cM con una distancia media entre marcadores de 2,6 cM, tratándose del primer mapa generado para estas especies (A. cherimola y A. squamosa). Los resultados obtenidos en este trabajo aportan nuevos conocimientos sobre aguacate y chirimoyo que son esenciales para la optimización de programas de mejora, pero también abren las puertas a futuros trabajos de estudio de la diversidad genética, conservación o evolución de las angiospermas. | es_ES |
dc.description.abstract | El aguacate (Persea americana Mill.) y el chirimoyo (Annona cherimola Mill.) son dos cultivos nativos de los Neotrópicos muy apreciados desde tiempos precolombinos. Además de su interés agrícola, tienen el valor añadido de pertenecer a uno de los grupos más primitivos de las angiospermas, por lo que son de gran importancia para estudios evolutivos en plantas. No obstante, la información molecular generada en estas especies es escasa, lo que dificulta su estudio y la disponibilidad de herramientas para optimizar el proceso de mejora. Con el objetivo de reducir esta brecha e incrementar los recursos genómicos disponibles en estas especies se ha llevado a cabo este estudio, que se divide en tres objetivos: (1) desarrollar marcadores moleculares SNPs mediante GBS para la caracterización de genotipos de aguacate (Persea americana Mill.), (2) ensamblar y anotar el primer genoma del chirimoyo (Annona cherimola Mill.) y (3) elaborar un mapa de ligamiento en el género Annona a partir de una población F2 generada a partir de un cruzamiento interespecífico (Annona cherimola ‘Fino de Jete’ x Annona squamosa ‘Thai seedless’). El desarrollo de un borrador de genoma de aguacate (cv. Hass) junto a la secuenciación de genotecas mediante GBS han permitido detectar un total de 7.108 SNPs, los cuales han facilitado la caracterización de 71 genotipos que representan las 3 razas botánicas (Mexicana, Guatemalteca y Antillana) de esta especie. Además, estos marcadores moleculares han facilitado la caracterización de la diversidad genética y la estructura poblacional, mostrando claras agrupaciones basadas en el origen racial. | es_ES |
dc.language.iso | spa | es_ES |
dc.publisher | UMA Editorial | es_ES |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/embargoedAccess | |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | * |
dc.subject | Plantas tropicales - Tesis doctorales | es_ES |
dc.subject | Genómica - Tesis doctorales | es_ES |
dc.subject.other | Subtropicales | es_ES |
dc.subject.other | Aguacate | es_ES |
dc.subject.other | Chirimoyo | es_ES |
dc.title | Desarrollo de herramientas genómicas en frutales subtropicales: aguacate y chirimoyo | es_ES |
dc.type | info:eu-repo/semantics/doctoralThesis | es_ES |
dc.centro | Facultad de Ciencias | es_ES |
dc.rights.cc | Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional | * |