Listar Investigación por autor "Ujaldon-Martinez, Manuel"
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Acelerando los momentos de Zernike sobre Kepler
Ruiz, Antonio; Ujaldon-Martinez, Manuel
(2014-05-02)
Este trabajo analiza las características más avanzadas de la arquitectura Kepler de Nvidia, principalmente el paralelismo dinámico para el lanzamiento de kernels desde la GPU y la planificación de hilos con Hyper-Q. ... -
Clasificación Tisular en GPU: aceleración y optimizaciones
(Servicio de Publicaciones y Divulgación Científica, 2015)Desde hace una década, los procesadores gráficos o GPUs vienen ganando protagonismo en la computación de altas prestaciones, contribuyendo a la aceleración de miles de aplicaciones en multitud de áreas de la ciencia. Pero ... -
DNA Sequences Alignment in Multi-GPUs: Energy Payoff on Speculative Executions
Pérez-Serrano, Jesús; Sandes, Edans; Melo, Alba; Ujaldon-Martinez, Manuel (2017-05-30)
We present a performance per watt analysis of CUDAlign 4.0, a parallel strategy to obtain the optimal alignment of huge DNA se- quences in multi-GPU platforms using the exact Smith-Waterman method. Speed-up factors and ... -
Entropy-based High Performance Computation of Boolean SNP-SNP Interactions Using GPUs
Riveros, Carlos; Ujaldon-Martinez, Manuel; Pablo, Moscato (2014-05-02)
It is being increasingly accepted that traditional statistical Single Nucleotide Polymorphism (SNP) analysis of Genome-Wide Association Studies (GWAS) reveals just a small part of the heritability in complex diseases. ... -
GPGPU: Challenges ahead
Ujaldon-Martinez, Manuel (2015-11-13)
Evolución, presente y futuro de la memoria DRAM del computador desde el punto de vista de los procesadores gráficos actuales, y su contribución presente y futura para la aceleración de aplicaciones científicas. -
GPUs for high performance computing, Deep learning and beyond
Ujaldon-Martinez, Manuel (2019-10-24)
After an impressive evolution within the last decade, Graphics Processing Units (GPUs) constitute nowadays a solid trend to accelerate scientific applications. This talk unveils the GPU architecture from an ... -
GPUs para HPC: Logros y perspectivas futuras
Ujaldon-Martinez, Manuel (2013-10-18)
Hace una década comenzábamos a mejorar las primeras aplicaciones científicas en GPUs utilizando Cg y OpenGL. Ahora CUDA y OpenCL han tomado el relevo, marcando un ritmo vertiginoso en la aceleración de códigos procedentes ... -
HPC Accelerators with 3D Memory
Ujaldon-Martinez, Manuel (2016-09-13)
After a decade evolving in the High Performance Computing arena, GPU-equipped supercomputers have con- quered the top500 and green500 lists, providing us unprecedented levels of computational power and memory bandwidth. ... -
Programming GPUs with CUDA
Ujaldon-Martinez, Manuel (2015-11-13)
Analizamos las prestaciones y características de las distintas generaciones de procesadores gráficos desarrollados por Nvidia para la programación de aplicaciones de propósito general bajo CUDA, un paradigma nuevo que ... -
Quantifying the regeneration of bone tissue in biomedical images via Legendre moments
We investigate the use of Legendre moments as biomarkers for an efficient and accurate classification of bone tissue on images coming from stem cell regeneration studies. Regions of either existing bone, cartilage or ... -
Smith-Waterman Acceleration in Multi-GPUs: A Performance per Watt Analysis
Pérez-Serrano, Jesús; Sandes, Edans; Melo, Alba; Ujaldon-Martinez, Manuel (Springer, 2017)
We present a performance per watt analysis of CUDAlign 4.0, a parallel strategy to obtain the optimal alignment of huge DNA se- quences in multi-GPU platforms using the exact Smith-Waterman method. Speed-up factors and ...