Comparación funcional de los secretomas de Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi NCPPB 3335 y P. savastanoi pv. phaseolicola 1448a: identificando estrategias de virulencia y mecanismos de interacción con el huésped.

Abstract

La bacteria fitopatógena Pseudomonas savastanoi es el agente causal de enfermedades en huéspedes leñosos y herbáceos de interés agronómico y ornamental. La especie P. savastanoi engloba 7 patovares denominados según el huésped del que se han aislado sus cepas. Para este trabajo hemos empleado cepas de los patovares savastanoi (Psv) y phaseolicola (Pph), aisladas de olivo y de judía, respectivamente. Ambas bacterias fitopatógenas presentan factores de virulencia específicos, como la síntesis de auxinas y citoquininas por Psv y la producción de faseolotoxina por Pph, ambas comparten la capacidad de translocar proteínas efectoras al interior de las células vegetales mediante un sistema de secreción tipo III (T3SS). Además del T3SS, las bacterias Gram-negativas presentan mecanismos adicionales para secretar proteínas al espacio extracelular. En este trabajo hemos caracterizado, mediante espectrometría de masas, el secretoma de las cepas Psv NCPPB 3335 y Pph 1448a, así como de sus mutantes en los genes hrpA, y hrpL. Del total de proteínas identificadas, se seleccionaron las que contenían péptido señal para su secreción, se descartaron aquellas con regiones hidrofóbicas y se filtraron según su localización subcelular, obteniéndose 321 proteínas secretadas independientemente del T3SS en Psv y 274 en Pph. Mediante análisis bioinformáticos funcionales comparativos detectamos 34 funcionalidades comunes entre Psv y Pph, correspondientes a 144 proteínas en Psv y 140 en Pph. A pesar de existir diferencias en la abundancia de estas proteínas, la redundancia funcional es elevada, lo que representaría el conjunto de proteínas fundamentales para el mantenimiento bacteriano. A su vez, el análisis funcional comparativo entre Psv y Pph mostró 28 funcionalidades exclusivas de Psv, representadas por 69 proteínas, y 13 funcionalidades exclusivas de Pph, representadas por 32 proteínas. En este caso, las proteínas exclusivas identificadas representarían aquellas estrategias diferenciales.