La rizosfera de las plantas es un hábitat complejo en el que se producen multitud de interacciones
entre los microorganismos que forman parte de su microbioma, siendo la competitividad de gran
importancia para la supervivencia y el establecimiento en dicho hábitat. Entre los diferentes
mecanismos de competitividad bacteriana se encuentra el sistema de secreción de tipo 6 (T6SS),
una jeringa molecular presente en bacterias Gram negativas que permite la secreción de diferentes
tipos de efectores, que, en bacterias beneficiosas, suelen presentar actividades relacionadas con
la competitividad frente a otras bacterias tanto beneficiosas como fitopatógenas, y que en última
instancia y por diferentes mecanismos provocan la muerte de la célula competidora. Desde la
rizosfera de árboles de aguacate se aislaron diferentes bacterias beneficiosas con propiedades PGP
(promotoras del crecimiento) entre las cuales se seleccionaron 3 Pseudomonas chlororaphis: P.
chlororaphis PCL1606, P. chlororaphis PCL1601 y P. chlororaphis subsp. piscium PCL1607
cuyos genomas fueron secuenciados. Mediante estudios in silico se detectaron clústeres
codificantes de T6SS en las tres cepas de estudio, lo cuales fueron localizados y analizados
filogenéticamente. Además, para comprobar su funcionalidad, se obtuvieron mutantes defectivos
por inserción de los que se analizaron su actividad en comparación con las cepas silvestres
empleando la bacteria Escheririchia coli como “presa” modelo. Una vez evaluada su
funcionalidad, se determinó la implicación de los distintos T6SS en la competitividad entre las
tres cepas de la misma especie (P. chlororaphis). Por último, se determinó la implicación de los
T6SS como potencial mecanismo de control biológico mediante la evaluación de la
competitividad de las tres cepas de estudio frente a bacterias fitopatógenas.