Los vasos linfáticos están revestidos por células endoteliales linfáticas (LEC) y son fundamentales para la salud. Sin embargo, aún no se ha dilucidado el papel del metabolismo en el desarrollo linfático. En este trabajo informamos que en modelos de ratones transgénicos, la pérdida específica de CPT1A por parte de las LEC, una enzima que controla la velocidad de la β-oxidación de los ácidos grasos, afecta al desarrollo linfático. Las LEC utilizan la β-oxidación de los ácidos grasos para proliferar y para la regulación epigenética de la expresión de marcadores linfáticos durante la diferenciación de las LEC. Desde el punto de vista mecanístico, el factor de transcripción PROX1 regula positivamente la expresión de CPT1A, lo que aumenta la producción de acetil coenzima A en función de la β-oxidación de los ácidos grasos. La acetil coenzima A es utilizada por la histona acetiltransferasa p300 para acetilar histonas en genes linfangiogénicos. La interacción PROX1-p300 facilita la acetilación preferencial de histonas en los genes diana de PROX1. A través de este mecanismo dependiente del metabolismo, PROX1 media cambios epigenéticos que promueven la linfangiogénesis. Cabe destacar que el bloqueo de las enzimas CPT1 inhibe la linfangiogénesis inducida por la lesión, y la reposición de acetil coenzima A mediante la administración de acetato desvía este proceso in vivo.