La aeropolisinina-1 es un metabolito bromado extraído de la esponja marina Aplysina aerophoba que ha sido caracterizado previamente por nuestro grupo como un potente compuesto antiangiogénico in vitro e in vivo. En este trabajo, proporcionamos evidencia de una inducción selectiva de la apoptosis por la aeropolisinina-1 en células endoteliales. Estudios sobre la morfología nuclear de las células tratadas revelaron que la aeropolisinina-1 induce condensación de la cromatina y fragmentación nuclear, y aumenta el porcentaje de células con contenido de ADN subdiploide en células endoteliales, pero no en células HCT-116, carcinoma de colon humano y fibrosarcoma humano HT-1080. El tratamiento de células endoteliales con aeropolisinina-1 induce la activación de las caspasas-2, -3, -8 y -9, así como la escisión de sustratos apoptóticos, como la poli (ADP-ribosa) polimerasa y la lamina-A en un mecanismo dependiente de caspasa. Nuestros datos indican un papel relevante de las mitocondrias en la actividad apoptogénica de este compuesto. La observación de que la aeropolisinina-1 previene la fosforilación de Bad se relaciona con la inducción de la apoptosis mediada por las mitocondrias por este compuesto.