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Listar BCGF - Contribuciones a congresos científicos por autor "Díaz-Martínez, Luis"
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Analysis of hypervariable DNA sequences by NGS technologies: QuasiFlow
Viguera-Mínguez, Enrique; Díaz-Martínez, Luis; Grande-Pérez, Ana; Claros-Díaz, Manuel Gonzalo; Seoane Zonjic, Pedro (2016-11-14)The development of Next Generation Sequencing (NGS) technologies has allowed deep characterization of highly variable sequences such as viral or mitochondrial genomes. With respect to RNA and ssDNA viruses, their low ... -
Analysis of viral quasispecies by NGS technologies: quasiflow
Díaz-Martínez, Luis; Seoane Zonjic, Pedro; Claros-Díaz, Manuel Gonzalo; Viguera-Mínguez, Enrique; Grande-Pérez, Ana (Sociedad Española de Virología, 2017)We have developed QuasiFlow, a workflow designed in AutoFlow that takes advantage of NGS technologies to reconstruct quasispecies based in Illumina reads. QuasiFlow characterises and computes several key parameters, such ... -
Comparación funcional de los secretomas de Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi NCPPB 3335 y P. savastanoi pv. phaseolicola 1448a: identificando estrategias de virulencia y mecanismos de interacción con el huésped.
Domínguez-Cerván, Hilario; Díaz-Martínez, Luis; Ramos-Rodríguez, Cayo Juan; Rodríguez-Moreno, Luis Gabriel (2024-06-17)La bacteria fitopatógena Pseudomonas savastanoi es el agente causal de enfermedades en huéspedes leñosos y herbáceos de interés agronómico y ornamental. La especie P. savastanoi engloba 7 patovares denominados según el ... -
Explorando el secretoma de Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi: Un enfoque bioinformático para el análisis de proteínas secretadas durante la interacción planta-patógeno
Domínguez Cerván, Hilario; Díaz-Martínez, Luis; Ramos-Rodríguez, Cayo Juan; Rodríguez-Moreno, Luis Gabriel (2023)La tuberculosis del olivo, causada por Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi (Psv), se caracteriza por la formación de tumores en los troncos y ramas de las plantas infectadas. Las bacterias gramnegativas poseen mecanismos ... -
Herramienta bioinformática para la identificación de motivos conservados en promotores bacterianos
Arroyo Mateo, Antonio; Delgado-Martín, Belén; Díaz-Martínez, Luis; Rodríguez-Moreno, Luis Gabriel; Ramos-Rodríguez, Cayo Juan (2023)Los factores de transcripción (FTs) son proteínas que se unen a secuencias específicas de ADN llamadas elementos reguladores, que se encuentran generalmente en las regiones promotoras de los genes. Al unirse a estos ... -
Infectivity decline of an RNA plant virus by increased mutagenesis in vivo
Díaz-Martínez, Luis; Brichette Mieg, Isabel; Grande-Pérez, Ana (2014-08-01)According to the lethal defection model, during lethal mutagenesis viral genomes with a low degree of mutation and low specific infectivity exert an interfering activity that leads to virus loss. Lethal mutagenesis of plant ... -
Infectivity decline of an RNA plant virus by increased mutagenesis supports the lethal defection model in vivo
Brichette Mieg, Isabel; Díaz-Martínez, Luis; Grande-Pérez, Ana (2013-07-30)Lethal mutagenesis is a new antiviral therapy based on increasing the mutation rate by using mutagenic base and nucleoside analogues whose molecular mechanisms are not fully understood. Most of the research has been conducted ... -
Involvement of translesion polymerases in the generation of genetic variability or an emergent ssDNA plant virus
Díaz-Martínez, Luis; Viguera-Mínguez, Enrique; Grande-Pérez, Ana (2015-06-16)Single-stranded DNA (ssDNA) viruses such as animal circoviruses or plant geminiviruses are important emergent viruses. SsDNA viruses are as variable as their RNA equivalents and evolve quickly, with high mutation rates and ...