Pseudomonas chlororaphis PCL1606 es una rizobacteria con capacidad de biocontrol frente a Rosellinia necatrix, agente causal de la podredumbre radicular blanca y Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycorpersici, que causa la podredumbre de cuello y raices de las plantas de tomate. Esta bacteria se caracteriza por la producción del antibiótico antifúngico 2-hexil, 5-propil resorcinol (HPR).
Para determinar las bases genéticas de la producción de HPR en P. chlororaphis PCL1606, se rastreó una genoteca genómica de PCL1606 empleando como sonda los genes dar decritos previamente como responsables de la producción de HPR en P. aurantica BL915. Tras el análisis, se aisló el plásmido pCGNOV-1, que contenía un clon genómico con la presencia de cinco genes homólogos a los genes dar.
Para determinar el papel de cada uno de los genes homólogos a los genes dar en la producción de HPR y su capacidad de biocontrol, se llevó a cabo la construcción de una colección de mutantes dirigidos en la producción de HPR por inserción. Además se obtuvieron los correspondientes complementantes de los mutantes defectivos. Sobre estos mutantes y sus respectivos complementates, se realizó una caracterización fenótipica de las propiedades relacionadas con el biocontrol, entre ellas la capacidad de antagonismo frente a Rosellina necatrix y Fusarium oxysporum, la producción de antibióticos y ensayos de control biológico en los sistemas experimentales aguacate-Rosellinia y tomate-Fusarium. Los resultados obtenidos muestran que los genes darA, darB pierden la capacidad de producir HPR. Esta propiedad queda restaurada al complementar cada uno de los mutantes con sus respectivos genes. Estos genes darA y darB junto con el gen darR, estan involucrados en la capacidad de biocontrol de la cepa silvestre P. fluorescens PCL1606.
En conclusión, la capacidad de biocontrol de la cepa P. chlororaphis PCL1606 depende de la producción de HPR, llevada a cabo por los genes dar.
Esta investigación ha sido apoyada por el Proyecto GL2011-30345-C02-01 (MICINN, España). CE Calderón recibió el apoyo de una beca de FPI, MICINN, España.